Majelis Ulama Indonesia menyerukan agar semua orang Muslim melaksanakan perang Jihad melawan Amerika dan sekutunya apabila mereka melakukan serangan terhadap Afghanistan. Dalam pernyataan hari ini, MUI yang beranggotakan ulama dari seluruh Indonesia, mengutuk serangan teror terhadap Amerika dan perbuatan itu bersifat kriminil serta menyalahi ajaran Islam. Tetapi pernyataan itu juga mengatakan serangan terhadap Afghanistan dipandang sebagai tindak permusuhan dan kebencian terhadap Islam. MUI mendesak pemerintah di Jakarta agar tidak mengijinkan penggunaan wilayah Indonesia oleh militer Amerika. Kelompok garis keras Islam di Indonesia, negara Islam terbesar didunia, telah mengancam akan mengusir warga AS dari Indonesia apabila serangan terhadap Afghanistan dilaksanakan. Presiden Megawati Sukarnoputri telah menyatakan dukungannya untuk perang global melawan terorisme.