Pemimpin tertinggi Iran, Ayatollah Ali Khamenei, mengatakan negaranya tidak akan membantu Amerika Serikat atau sekutunya dalam serangan melawan Afghanistan. Ia mengatakan Amerika Serikat tidak patut memimpin perang sedunia melawan terorisme karena dukungannya pada Israel. Ayatollah Khamenei mengutuk terorisme tetapi mengatakan Iran tidak akan turut dalam setian tindakan dibawah pimpinan Amerika Serikat. Kemudian, Menteri Luar Negeri Iran Kamal Kharrazi mengatakan Amerika Serikat mempunyai hak untuk membela diri kalau Amerika dapat mengetahui secara pasti pihak yang bertanggung jawab atas serangan tanggal 11 September di New York dan Washington.